集团主要生产基地是分别位于清远高新技术开发区的广东在田药业有限公司和位于广州经济开发区的广州健泽药业有限公司。两个基地占地面积138亩，2003年钟南山院士及省市相关领导参加了基地的奠基仪式。广东在田药业有限公司是健泽集团2002年与广州医学院合作、投资人民币4000余万元建成并通过国家GMP认证的现代化制药企业。广州健泽药业有限公司是健泽集团2006年与香港星泽公司合作并投资人民币6000余万元在广州经济开发区按照国家GMP要求建设的中药生产企业，专业从事中药饮片研发、生产和销售，是中国中药饮片协会会员单位，已成为广州中医药大学主要的中药产学研基地和教学基地。